Ambas son correctas.
Boto se refiere a una bota alta. También se usa como adjetivo significando torpe de ingenio.
- Al jinete se le perdieron sus botos camperos.
Voto se refiere a una expresión pública o secreta ante una opción.
- El voto es secreto.
- Los miembros dieron su voto a la alternativa menos pensada.
- Pronto ejerceremos el voto libre para cambiar.